Držitelka environmentální ceny
V neziskovém sektoru Čaputová působila jako spolupracovnice občanského sdružení Via iuris, které se věnuje posilování právního státu. V neziskovém sektoru se zaobírala také tématem týraných a zneužívaných dětí. Jako právnička občanské iniciativy Skládka nepatří do města byla v roce 2016 oceněna Goldmanovou environmentální cenou. Problematice skládky v domovském Pezinku se věnovala 14 let. Je členkou celosvětové sítě environmentálních právníků ELAW.
