Eva Holubová se angažuje také v politice a charitě. V roce 2014 vstoupila do Liberálně ekologické strany, před třemi lety se objevila ve volebním štábu Jiřího Drahoše a v roce 2019 se zúčastnila demonstrací Milion chvilek pro demokracii v Praze proti Babišově vládě. V prezidentské kampani byla hlasitou podporovatelkou Petra Pavla.
