Oba rodiče Kristen pracují ve filmovém průmyslu. Otec John Stewart je divadelním ředitelem a producentem společnosti Fox. Matka Jules Mann-Stewartová je scenáristkou a režisérkou. Kristen má ještě mladšího bratra Camerona a dva adoptované bratry Taylora a Dana. V roce 2012 Kristen zasáhla zpráva, že se její rodiče budou rozvádět.
