Areál ústavu se v průběhu let také zvětšoval a v roce 2005 byl ke komplexu přičleněn nový blok částečně zapuštěný do vyšehradské skály. Zde se nachází na třech podlažích porodní sály, tři operační sály pro gynekologickou a porodnickou operativu a centrální sterilizace.
