V té době se jí moc nedařilo ani v soukromí. Vzala si kameramana Jana Eisnera, ale zanedlouho se rozvedli. Jejím celoživotním partnerem se později stal herec a režisér Stanislav Remunda, s nímž má dvě dcery, Sabinu a Theodoru, rovněž herečky. Janžurová se za něj nikdy neprovdala, po rozvodu s Eisnerem preferovala život na psí knížku. Svého partnera ovšem velmi milovala. Remunda zemřel v roce 2012 ve věku 84 let.
