Po rozpadu manželství s Garnerovou randil Affleck v letech 2017 až 2019 s producentkou Lindsay Shookusovou. Ačkoliv spolu dvojice vypadala spokojeně, přišlo pár rozchodů, během kterých Ben nezůstal sám. Pár se podle ET online oficiálně rozešel v roce 2019 kvůli odlišným a náročným pracovním programům.
