V roce 2016 zemřela její matka Nancy Dowová, se kterou měla herečka napjaté vztahy. Kritického bodu dosáhly v roce 1999, kdy Dowová publikovala své memoáry, ve kterých detailně popsala život své dcery a jejich vztah. Herečka proto svou matku nepozvala ani na jednu ze svých svateb.
Dowová vůči své dceři nešetřila kritikou, ať už šlo o její vzhled nebo ambice. "Byla vůči mně hodně kritická. Protože byla modelka, byla nádherná, až omračující. Já ne. Nikdy jsem nebyla," vzpomínala Anistonová, kterou časopis People dvakrát vyhlásil za nejkrásnější ženu světa. "Byla také velmi nemilosrdná. Pociťovala zášť, což mi přišlo malicherné."
S matkou se smířila teprve na jejím smrtelném loži.
